Trên các tuyến sông trên địa bàn tỉnh hiện có 111 bến thủy nội địa, trong đó có 86 bến hàng hóa, 25 bến khách ngang sông.
Để hoạt động của các bến thủy nội địa theo đúng quy định, đáp ứng nhu cầu vận chuyển, bốc xếp hàng hóa, vận chuyển hành khách, trong quy hoạch các cảng thủy nội địa đến năm 2020, toàn tỉnh có 5 cảng hàng hóa, 5 cảng hành khách.
Đối với các bến thủy nội địa, quy hoạch 31 bến và cụm bến hàng hóa, tương ứng với 46 vị trí bến thủy nội địa; quy hoạch 24 bến khách ngang sông. Ngoài ra, tỉnh chỉ đạo ngành chuyên môn nghiên cứu đề xuất quy hoạch 3 cảng cạn tại các huyện Văn Lâm, Yên Mỹ.