Lực lượng thanh tra giao thông Sở Giao thông Vận tải Bắc Ninh được biên chế thành 1 bộ phận thường trực và 3 đội trực thuộc. Lực lượng này đã thực hiện nhiều cuộc thanh tra trên các lĩnh vực GTVT, góp phần bảo vệ các tuyến đường, công trình giao thông, phục vụ nhu cầu phát triển kinh tế - xã hội của địa phương.