Năm 2016, nhờ làm tốt công tác cải cách hành chính, qua kết quả đánh giá xếp loại chỉ số CCHC của tỉnh, Sở Giao thông vận tải Sơn La đạt 96,75 điểm, tăng 3,6 điểm so với điểm đánh giá năm 2015 và duy trì xếp thứ 2 trong bảng đánh giá thứ hạng các sở, ban, ngành của tỉnh.