Ban Tổ chức sẽ do Thứ trưởng Nguyễn Văn Công làm Trưởng ban. Các Phó Trưởng ban bao gồm: Vụ trưởng Vụ Vận tải Trần Bảo Ngọc; Chánh Văn phòng Bộ Nguyễn Trí Đức.
Thành viên Ban tổ chức bao gồm ông Nguyễn Công Bằng, Phó Vụ trưởng Vụ Vận tải và đại diện lãnh đạo các Vụ Tài chính; Viện Chiến lược và phát triển GTVT; Tổng cục Đường bộ Việt Nam; Cục Hàng không Việt Nam; Cục Đường sắt Việt Nam; Cục Hàng Hải Việt Nam; Cục Đường thủy nội địa Việt Nam; Tổng công ty Hàng hải Việt Nam; Tổng công ty Hàng không Việt Nam – CTCP; Tổng công ty Đường sắt Việt Nam; Báo Giao thông; Trung tâm Công nghệ thông tin và Tạp chí giao thông.
Ban Tổ chức có nhiệm vụ chuẩn bị các báo cáo, tài liệu của Hội nghị; các bài phát biểu, kết luận của Lãnh đạo Bộ Giao thông vận tải tại Hội nghị; xây dựng Kế hoạch tổ chức; chuẩn bị kinh phí; xây dựng Quyết định tổ chức, chương trình và giấy mời Hội nghị; tổ chức in ấn, cấp phát tài liệu; bố trí địa điểm, đón tiếp đại biểu, khách mời của Hội nghị và xử lý các vấn đề phát sinh về tổ chức trong quá trình diễn ra Hội nghị; Phối hợp với các đơn vị, cơ quan báo chí tuyên truyền, phổ biến, giới thiệu về việc tổ chức Hội nghị; thực hiện các công việc khác theo chỉ đạo của Bộ trưởng.
Các thành viên Ban Tổ chức Hội nghị làm việc theo chế độ kiêm nhiệm và thực hiện nhiệm vụ theo sự phân công của Trưởng ban; Ban Tổ chức Hội nghị tự giải thể sau khi hoàn thành các nhiệm vụ.